Hráči hrají 'EteRNA' Just Beat profesionální věda na tento klíčový objev

Občanská věda šla na další úroveň: Videohry vytvořily biologický objev a nyní jsou publikovány recenzovaným vědeckým časopisem.

Publikováno tento týden v Žurnál molekulární biologie, řada intuitivně vyvinutých pravidel pro to, jak obtížný bude určitý tvar, dosáhnout prostřednictvím návrhu RNA. Například zjistili, že čím více symetrický tvar je, tím těžší bude navrhnout řetězec RNA, který bude odpovídat tomuto tvaru.

Kolektiv video hráčů objevil objev, EteRNA, hra, která vyzývá hráče, aby brali vlákna RNA a skládali je do požadovaného tvaru změnou jejich chemického make-upu. Vědecký problém skládání RNA do konkrétního tvaru je složitý, ale hra není - pro zahájení hraní není nutné žádné pochopení biochemie.

Hráči vzali výzkumnou otázku z vlastního podnětu, jako způsob, jak dát novějším hráčům nástroje k posouzení relativní obtížnosti různých hádanek. Zjištění pomůže budoucímu biomedicínskému výzkumu, protože nový soubor pravidel dává vědcům lepší pocit, zda se snažit skládat RNA do daného tvaru je marným cvičením.

„Tento výzkum naznačuje, že standardní paradigma vědeckého crowdsourcingu může být překlopena,“ říká Rhiju Das, profesor biochemie ve Stanfordu. Inverzní v e-mailu. EteRNA byl zahájen v roce 2011 Das a Adrien Treuille, odborný asistent počítačové vědy na Carnegie Mellon University. „ EteRNA hráči si mohou vymyslet vlastní výzkumné otázky a napsat své vlastní příspěvky. V tomto výzkumu bylo málo pokynů a nezávislých testů od odborníků v mé laboratoři. “

Syntetizovaná RNA má neuvěřitelný potenciál pro novou generaci léčiv a léčebných terapií. Jestliže to může být složeno do správného tvaru, RNA může být postavena zacílit na specifické viry, rakoviny a dokonce genetické poruchy. CRISPR, proces úpravy genů, který by mohl dramaticky pozměnit budoucnost lidské existence, používá RNA k vedení enzymu Cas9, který vede k řezání DNA, k nežádoucí části DNA.

EteRNA začal jako fórum pro odborné vědce, aby představil hráčům hádanky, ale od té doby se rozrostl. Hra a její 100 000 registrovaných hráčů nyní existuje v symbiotickém a rozvíjejícím se vztahu s profesionálními vědci a počítačovými modely postavenými na návrhu a testování struktury RNA.

„Počítačové modelování a EteRNA nejsou exkluzivní, “říká Das. „ EteRNA sdružuje spoustu lidí, z nichž někteří píšou vlastní počítačové modely. “

V aktuálním článku, hráči spolupracovali psali skripty otestovat jejich nápady na co dělá RNA struktury obtížné navrhnout. Das říká, že někteří hráči mu řekli, že jsou obzvláště nadšeni automatizovat své nápady do počítačových modelů, protože chtějí pokračovat a řešit těžší problémy.

Problémy vytvořené EteRNA hráči ve skutečnosti pokračují v syntéze v laboratoři Das '- zatím bylo postaveno 86 459 sekvencí generovaných hráči.

Hlavní autoři příspěvku byli EteRNA hráči Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju a Michelle Wu. Wu je také Ph.D. student v biomedicínské informatiky na Stanfordu.

V budoucnu by to mohlo být tak, že odborníci z řad občanů začnou vydávat vědecké objevy zcela nezávisle.

„Tento„ převrácený crowdsourcing “šablona pro občanskou vědu by mohla být užitečná pro další projekty a oblasti vědy, jako je astronomie (Zoo Galaxy) nebo identifikaci druhu davu (Čárový kód života), “Říká Das. „Zvláště, pokud ano EteRNA, ve fázi psaní papíru vidí úzká místa. “